Tersembunyi di pegunungan dekat Sekolah Menengah Kunugigaoka yang bergengsi, terdapat sebuah bangunan kecil yang terbengkalai yang menjadi tempat bagi para siswa nakal dan putus sekolah dari Kelas 3-E. Dipandang rendah oleh teman-teman sebayanya, para siswa di kelas ini tampaknya tak punya banyak harapan untuk melanjutkan karier akademis mereka. Setidaknya, sampai pemerintah pusat menugaskan mereka untuk mengeliminasi ancaman terbesar bagi planet mereka: guru baru mereka.

Setelah menghancurkan bulan, profesor yang mirip gurita—yang dijuluki "Koro-sensei"—kini mengancam akan menghancurkan Bumi pada bulan Maret tahun berikutnya. Mengingat misi mereka, para siswa menyadari bahwa membunuhnya lebih mudah diucapkan daripada dilakukan. Koro-sensei tidak hanya mampu bergerak dengan kecepatan hingga Mach 20, tetapi juga kebal terhadap hampir semua senjata di Bumi. Ironisnya, ia juga terbukti sebagai salah satu guru terbaik yang pernah dimiliki Kelas 3-E. Dengan melatih kelas tersebut untuk unggul baik dalam studi mereka sebagai siswa maupun keterampilan sebagai pembunuh, Koro-sensei yakin bahwa kecerdikan dan tekad tak tergoyahkan para siswanya dapat mengembalikan mereka ke kampus utama.

Melalui proses coba-coba, Nagisa Shiota, serta murid-murid Kelas 3-E lainnya, harus menemukan kelemahan Koro-sensei—dan secepatnya, karena nasib dunia bergantung padanya.

[Ditulis oleh MAL Rewrite]

Catatan: Sinopsis diterjemahkan secara otomatis oleh Google Translate.